2007 decemberében elvette feleségül Cecilia Galeanót, a házasságkötésre titokban került sor, amiből aztán egy botrány is keveredett. Az egyik vendég ugaynis néhány nappal az esküvő előtt eladta az esküvőn készült képeket az egyik mexikói hetilapnak 

Cecilia már egy korábbi kapcsolatából született egy kislánya, Valentina aki 2000-ben látta meg a napvilágot. A lányt  Sebastán úgy nevelte mindig is, mintha a saját gyermeke volna. A házasságkötés után nem titkolták, hogy szeretnének egy gyermeket. Cecilia hamar teherbe is esett, és a fiatal pár nagyon boldog volt. Sebastian kijelentette, hogy a pici igazából a második gyermeke lesz, hiszen Valentinára is saját gyermekeként tekint. Azonban az öröm után sajnos nagyon szomorú szakasz következett, ugyanis Cecilia elvetélt. A pár továbbra is szeretett volna egy gyermeket. 2009 őszén boldogan be is jelentették, hogy Cecilia újra állapotos, mégpedig egy kisfiúval.A baba végül nyolc hónapra született, 2010 januárjában, és császármetszéssel jött a vilára, és a Santiago nevet kapta.

A házasság azonban 2011-ben véget ért, először csak átmeneti krízisre hivatkoztak, majd úgy döntöttek, végleg elválnak útjaik.  A kapcsolatnak Cecilia túlzott féltékenysége vetett véget. 2012 januárjában Mariana Seoane színésznővel  kapta lencsevégre egy lesifotós, amint kéz a kézben távoznak egy étteremből. A későbbiekben kiderült, hogy nem alkotnak egy párt. 2012. májusában több paparazzi fotó is megjelent, melyek azt bizonyítják, hogy Aracely Arámbula és Sebastián Rullí között szerelmi viszony szövődött. Júniusban pedig hivatalossá vált, hogy egy párt alkotnak. 2013 őszén viszont véget ért a kapcsolatuk, közös megegyezéssel. A hírt Sebastian  a Twitteren osztotta meg a rajnogóival 

2014. szeptemberében bejelentették, hogy  a francia származású színésznővel, Angelique Boyerrel alkot egy párt, akivel 2010-ben ismerkedett meg.